Підвищений ТТГ при знижених вільних Т3 і Т4 означає первинний гіпотиреоз, а антитіла до тиреоїдної пероксидази й тиреоглобуліну називають його причину — хронічний аутоімунний тиреоїдит. Лімфоцитарна інфільтрація й антитілозалежний лізис руйнують тиреоцити, тому функціонуючої тканини бракує навіть при збільшеній залозі.